Perú es el país pionero en descentralizar la implementación del EITI a nivel regional, lo que ha permitido transparentar los recursos transferidos por el Estado a las instituciones de ámbito sub-nacional y los usos de estos recursos por parte de estas entidades (Gobierno regional, gobiernos locales, entre otros). Los EITI regionales están integrados por representantes de sociedad civil, empresas y Estado, específica de cada región; las cuales están refrendadas por ordenanzas regionales, en donde se estipulan sus funciones, ámbito de trabajo y los integrantes.

Actualmente, se cuenta con cinco comisiones regionales EITI instaladas y activas (Moquegua, Piura, Arequipa, Loreto y Apurímac) y tres nuevas regiones (Áncash, La Libertad y Cajamarca) que se encuentran en proceso de conformación de sus respectivas comisiones regionales.